در ۲۸ دی ۱۳۹۳ برابر با ۲۸ ژانویه ۲۰۱۵، جهاد مغنیه به همراه گروهی از نیرو‌های حزب‌اللّه هنگام بازدید از شهر «مزرعه الامل» در منطقه «قنیطره»، هدف حمله موشکی بالگرد اسرائیلی قرار گرفت و شهید شد. تحلیلگران معتقدند که تصمیم ترور جهاد مغنیه از سوی شخص بنیامین نتانیاهو نخست وزیر وقت اسراییل صادر شده بود.
